Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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