Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim39Q9ESN2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim39Q9ESN2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim39Q9ESN2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim39Q9ESN2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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