Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms