Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm7Q9ESD6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms