Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp29Q9ES63 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp29Q9ES63 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms