Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms