Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rhox9Q9EQM5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rhox9Q9EQM5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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