Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC5

Rbp7, Retinoid-binding protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp7Q9EPC5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rbp7Q9EPC5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rbp7Q9EPC5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms