Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpr88Q9EPB7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpr88Q9EPB7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms