Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn3Q9DCB1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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