Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms