Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Med27Q9DB40 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Med27Q9DB40 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms