Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem239Q9DA47 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem239Q9DA47 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms