Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms