Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Calr3Q9D9Q6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms