Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms