Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntd1Q9D995 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms