Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms