Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9D8Q6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms