Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc91Q9D8L5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc91Q9D8L5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms