Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms