Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem54Q9D7S1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms