Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2310002L09RikQ9D7L5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2310002L09RikQ9D7L5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms