Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms