Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl40Q9D783 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl40Q9D783 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms