Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbe1Q9D6Y9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms