Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms