Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ttc9bQ9D6E4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ttc9bQ9D6E4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ttc9bQ9D6E4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ttc9bQ9D6E4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ttc9bQ9D6E4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ttc9bQ9D6E4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms