Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms