Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms