Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
4931428L18RikQ9D4S9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms