Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms