Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Phf6Q9D4J7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms