Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lonrf3Q9D4H7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms