Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap53Q9D439 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cfap53Q9D439 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap53Q9D439 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms