Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms