Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pramef12Q9D2F1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms