Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6bQ9D289 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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