Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cysrt1Q9D1E4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cysrt1Q9D1E4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms