Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mrpl28Q9D1B9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mrpl28Q9D1B9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Mrpl28Q9D1B9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mrpl28Q9D1B9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Mrpl28Q9D1B9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Mrpl28Q9D1B9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Mrpl28Q9D1B9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrpl28Q9D1B9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Mrpl28Q9D1B9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms