Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc47Q9D024 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc47Q9D024 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms