Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snf8Q9CZ28 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snf8Q9CZ28 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snf8Q9CZ28 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snf8Q9CZ28 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Snf8Q9CZ28 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snf8Q9CZ28 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snf8Q9CZ28 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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