Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChtopQ9CY57 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms