Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx7Q9CY18 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx7Q9CY18 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms