Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmed5Q9CXE7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmed5Q9CXE7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms