Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Prdm5Q9CXE0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm5Q9CXE0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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