Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pin4Q9CWW6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms