Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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