Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ddx28Q9CWT6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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