Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP8

Pold4, DNA polymerase delta subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold4Q9CWP8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pold4Q9CWP8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pold4Q9CWP8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold4Q9CWP8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms